پنجره Application Builder در دسکتاپ COMSOL شامل درخت برنامه است . این درخت گره ها را از ساختار داده Application Builder و گره ها را از مدل تعبیه شده نمایش می دهد. همه گره‌های مدل تعبیه‌شده دقیقاً مانند گره‌های درخت مدل هنگام کار با Model Builder رفتار می‌کنند. درخت برنامه همچنین شامل یک گره ریشه برنامه و شاخه های زیر در زیر گره ریشه است:
|
•
|
|
•
|
|
•
|
شعبه ورودی ها
|
|
•
|
تم ها
|
|
•
|
شعبه پنجره اصلی
|
|
•
|
شعبه فرم ها
|
|
•
|
شعبه رویدادها
|
|
•
|
شعبه اعلامیه ها
|
گره ریشه ( 
) در Application Builder شبیه گره ریشه در Model Builder است، اما همچنین شامل یک بخش Application با تنظیمات خاص برنامه ها می باشد (برای اطلاعات بیشتر به The Root Settings Windows در COMSOL Multiphysics Reference Manual مراجعه کنید).
) در Application Builder شبیه گره ریشه در Model Builder است، اما همچنین شامل یک بخش Application با تنظیمات خاص برنامه ها می باشد (برای اطلاعات بیشتر به The Root Settings Windows در COMSOL Multiphysics Reference Manual مراجعه کنید).
