 |
الکتروفورز زون
معرفی
الکتروفورز ناحیه (ZE) یک روش جداسازی الکتروفورتیک است که معمولاً برای آنالیز پروتئین‌ها، اسیدهای نوکلئیک و بیوپلیمرها استفاده می‌شود. در طول فرآیند، گونه‌های مختلف در یک نمونه در یک سیستم بافر الکترولیت پیوسته، تحت یک گرادیان پتانسیل حمل می‌شوند. به دلیل تفاوت در تحرک، گونه های موجود در نمونه ها در نهایت به قله های مختلف، به خوبی تفکیک شده، جدا می شوند.
این آموزش رابط حمل و نقل الکتروفورتیک را معرفی می کند. یک سیستم بافر، متشکل از یک اسید استیک و تریس (تریس (هیدروکسی متیل) آمینو متان)، برای جدا کردن نمونه ای متشکل از پیریدین و آنیلین به دو قله خوب استفاده می شود. این مدل بر اساس مقاله مروری تورمن و دیگران ( مراجعه 1 ) است.
تعریف مدل
هندسه مدل با فاصله 1 بعدی نشان داده می شود که نشان دهنده طول (20 سانتی متر) ستون جداسازی است. فرض می شود که مرزهای بازه رو به مخازن حاوی مقادیر زیادی الکترولیت بافر باشد.
حمل و نقل چهار گونه مختلف شامل: اسید استیک، تریس، آنیلین و پیریدین است. اسید استیک به عنوان اسید ضعیف تعریف می شود، در حالی که گونه های دیگر به عنوان بازهای ضعیف تعریف می شوند. هر گونه با یک تحرک و یک ثابت اسیدی (pKa) مشخص می شود . برای بازهای ضعیف pKa به ثابت اسیدی اسید مزدوج اشاره دارد. شرایط اولیه و مرزی نیز برای هر گونه به صورت جداگانه مشخص شده است. غلظت اولیه برای اسید استیک و تریس در طول بازه ثابت است، در حالی که غلظت نمونه آنیلین و پیریدین با استفاده از یک تابع مستطیلی با عرض 2.5٪ از فاصله، که نزدیک به سمت چپ ترین مرز قرار دارد، تعریف می شود.
علاوه بر غلظت گونه ها، رابط حمل و نقل الکتروفورتیک نیز برای pH و توزیع پتانسیل الکترولیت حل می شود. چگالی جریان 2500 A/m2 در انتهای ستون جداسازی اعمال می شود.
این مدل با استفاده از یک حلگر وابسته به زمان حل می شود و الکتروفورز را در مدت 5 دقیقه شبیه سازی می کند.
نتایج و بحث
شکل های 1 تا 4 توزیع pH، هدایت، تریس و اسید استیک را به ترتیب در دقیقه 0 و 4 نشان می دهند. شکل 1 که pH را نشان می‌دهد، یک نشان مستطیلی از غلظت اولیه نمونه در 0 دقیقه و یک الگوی توزیع پیچیده‌تر در 4 دقیقه را نشان می‌دهد. شکل 2 یک الگوی مشابه، اما با ارتفاع قله نسبی متفاوت را نشان می دهد.
شکل 1: توزیع pH در 0 و 4 دقیقه.
شکل 2: هدایت الکترولیت در دقیقه 0 و 4.
شکل 3 و شکل 4 توزیع غلظت گونه های الکترولیت بافر را نشان می دهد. تریس و اسید استیک توجه داشته باشید که چگونه موقعیت اولیه نمونه در t = 0 پس از 4 دقیقه به عنوان پیک “شبح” در الکترولیت بافر ظاهر می شود.
شکل 3: غلظت تریس در دقیقه 0 و 4.
شکل 4: غلظت اسید استیک در دقیقه 0 و 4.
در نهایت، شکل 5 و شکل 6 غلظت نمونه پیریدین و آنیلین را در دقیقه 1 و 3 نشان می دهد. قله ها به شکل مثلث هستند و فاصله قله تا قله با حرکت نمونه ها به سمت راست در ستون جداسازی افزایش می یابد.
شکل 5: غلظت نمونه در 1 دقیقه.
شکل 6: غلظت نمونه در 3 دقیقه.
ارجاع
1. W Thormann, M Breadmore, J. Caslavska, and R. Mosher, “Dynamic computer simulations of electrophoresis: A همه کاره تحقیق و ابزار آموزشی” Electrophoresis , vol. 31، صفحات 726-754، 2010.
مسیر کتابخانه برنامه: ماژول_مهندسی_واکنش_شیمیایی/اثرات_الکتروکینیتیک /زون_الکتروفورزیس
دستورالعمل های مدل سازی
از منوی File ، New را انتخاب کنید .
جدید
در پنجره جدید ، روی 
Model Wizard کلیک کنید .
Model Wizard کلیک کنید .مدل جادوگر
1 | در پنجره Model Wizard ، روی  1D کلیک کنید . |
2 | در درخت Select Physics ، Chemical Species Transport>Electrophoretic Transport (el) را انتخاب کنید . |
3 | روی افزودن کلیک کنید . |
4 |  روی مطالعه کلیک کنید . |
5 | در درخت Select Study ، Preset Studies for Selected Physics Interfaces>Time Dependent with Initialization را انتخاب کنید . |
6 |  روی Done کلیک کنید . |
تعاریف جهانی
با بارگیری برخی از پارامترهای مدل از یک فایل متنی شروع کنید.
پارامترهای 1
1 | در پنجره Model Builder ، در قسمت Global Definitions روی Parameters 1 کلیک کنید . |
2 | در پنجره تنظیمات برای پارامترها ، بخش پارامترها را پیدا کنید . |
3 |  روی Load from File کلیک کنید . |
4 | به پوشه Application Libraries مدل بروید و روی فایل zone_electrophoresis_parameters.txt دوبار کلیک کنید . |
اکنون لیست پارامترها شامل پارامترهای مختلفی مانند L ، T ، mob_HAC و غیره است. اینها هنگام تعریف مدل استفاده خواهند شد.
هندسه 1
هندسه مدل را به صورت فاصله ای بین 0 و پارامتر L (20 سانتی متر) رسم کنید.
فاصله 1 (i1)
1 | در پنجره Model Builder ، در قسمت Component 1 (comp1) روی Geometry 1 کلیک راست کرده و Interval را انتخاب کنید . |
2 | در پنجره تنظیمات برای فاصله ، قسمت فاصله را بیابید . |
3 | در جدول تنظیمات زیر را وارد کنید: |
مختصات (M) |
0 |
L |
4 |  روی Build Selected کلیک کنید . |
حمل و نقل الکتروفورتیک (EL)
حالا شروع به تنظیم فیزیک کنید. تعدادی گره قبلاً به طور پیش فرض اضافه شده است.
حلال 1
گره حلال شامل تنظیمات مختلفی در رابطه با حلال آبی است. توجه داشته باشید که دما بعداً در گره ورودی های مدل پیش فرض تنظیم می شود .
عایق 1
یک عایق نیز به طور پیش فرض ایجاد شده است. بعداً وقتی شرایط مرزی را برای پتانسیل اضافه کنید لغو می شود.
پتانسیل اولیه 1
اگر مدل شامل واکنش های الکترود وابسته به پتانسیل نباشد، پتانسیل اولیه معمولاً نباید به طور صریح تنظیم شود. تنظیمات را همانطور که هست رها کنید.
پایه ضعیف – تریس
اکنون شروع به اضافه کردن گره های گونه های مختلف به مدل کنید. با پایه ضعیف الکترولیت بافر (تریس) شروع کنید.
1 | در پنجره Model Builder ، روی Electrophoretic Transport (el) کلیک راست کرده و Weak Base را انتخاب کنید . |
هر گونه اضافه شده به مدل معادلات خود را اضافه می کند و غلظت گونه را به عنوان متغیر وابسته حل می کند. برای گونه ای با مراحل تفکیک، متغیر غلظت وابسته به غلظت کل (مجموع همه زیرگونه های تفکیک شده مربوط به گونه) اشاره دارد.
2 | در پنجره تنظیمات برای پایگاه ضعیف ، پایگاه ضعیف – tris را در قسمت متن برچسب تایپ کنید . |
انتخاب Domain به طور پیش فرض روی All domains تنظیم شده است ، بنابراین برای این مدل نیازی به تغییر این انتخاب نیست. با این حال، تنظیمات بخش انتخاب را می توان برای تعیین اینکه یک گونه فقط در بخش های خاصی از هندسه وجود داشته باشد استفاده کرد.
نام گونه ، که باید منحصربه‌فرد باشد، تعیین می‌کند که رابط حمل و نقل الکتروفورتیک چگونه تعدادی از متغیرها، مانند غلظت‌ها و شارها را نام‌گذاری می‌کند.
3 | قسمت Weak Base را پیدا کنید . در قسمت متن نام گونه ، tris را تایپ کنید . |
گره پایه ضعیف به طور پیش فرض از یک واکنش تفکیک ( Monoprotic ) استفاده می کند که با یک مقدار pKa مشخص می شود.
4 | در قسمت متن p K a ، pKa_tris را تایپ کنید . |
5 | قسمت Diffusion and Migration را پیدا کنید . در قسمت متن u m ، mob_tris را تایپ کنید . |
غلظت اولیه 1
شرایط مرزی و مقادیر اولیه برای یک گونه با استفاده از گره های فرزند تنظیم می شود.
گره Initial Concentration غلظت را هنگام شروع شبیه سازی تعریف می کند.
1 | در پنجره Model Builder ، گره Weak Base – tris را گسترش دهید ، سپس روی Initial Concentration 1 کلیک کنید . |
2 | در پنجره تنظیمات برای تمرکز اولیه ، قسمت تمرکز اولیه را پیدا کنید . |
3 | در قسمت متن c ، tris_c0 را تایپ کنید . |
پایه ضعیف – تریس
گره Concentration غلظت را در یک مرز، در این مورد مخزن ورودی تعریف می کند.
1 | در پنجره Model Builder ، روی Weak Base – tris کلیک کنید . |
تمرکز 1
1 | در نوار ابزار Physics ، روی  Attributes کلیک کنید و Concentration را انتخاب کنید . |
2 | فقط مرز 1 را انتخاب کنید. |
3 | در پنجره تنظیمات برای تمرکز ، بخش تمرکز را پیدا کنید . |
4 | در قسمت متنی c 0 ، tris_c0 را تایپ کنید . |
پایه ضعیف – تریس
گره خروجی مرزی با شار انتشاری صفر برای گونه تعریف می کند. این یک شرایط مناسب برای مرزهایی است که گونه به یک مخزن منتقل می شود.
1 | در پنجره Model Builder ، روی Weak Base – tris کلیک کنید . |
خروجی 1
1 | در نوار ابزار Physics ، روی  Attributes کلیک کنید و Outflow را انتخاب کنید . |
2 | فقط مرز 2 را انتخاب کنید. |
اسید ضعیف – HAC
اکنون به طور مشابه برای ایجاد اسید ضعیف الکترولیت بافر (HAC) اقدام کنید.
1 | در نوار ابزار Physics ، روی  Domains کلیک کنید و Weak Acid را انتخاب کنید . |
2 | در پنجره تنظیمات برای اسید ضعیف ، اسید ضعیف – HAC را در قسمت متن برچسب تایپ کنید . |
3 | قسمت اسید ضعیف را پیدا کنید . در قسمت متن نام گونه ، HAC را تایپ کنید . |
4 | در قسمت متن p K a ، pKa_HAC را تایپ کنید . |
5 | قسمت Diffusion and Migration را پیدا کنید . در قسمت متن u m ، mob_HAC را تایپ کنید . |
غلظت اولیه 1
1 | در پنجره Model Builder ، گره Weak Acid – HAC را گسترش دهید ، سپس روی Initial Concentration 1 کلیک کنید . |
2 | در پنجره تنظیمات برای تمرکز اولیه ، قسمت تمرکز اولیه را پیدا کنید . |
3 | در قسمت متن c ، HAC_c0 را تایپ کنید . |
اسید ضعیف – HAC
در پنجره Model Builder ، روی Weak Acid – HAC کلیک کنید .
تمرکز 1
1 | در نوار ابزار Physics ، روی  Attributes کلیک کنید و Concentration را انتخاب کنید . |
2 | فقط مرز 2 را انتخاب کنید. |
3 | در پنجره تنظیمات برای تمرکز ، بخش تمرکز را پیدا کنید . |
4 | در قسمت متنی c 0 ، HAC_c0 را تایپ کنید . |
اسید ضعیف – HAC
در پنجره Model Builder ، روی Weak Acid – HAC کلیک کنید .
خروجی 1
1 | در نوار ابزار Physics ، روی  Attributes کلیک کنید و Outflow را انتخاب کنید . |
2 | فقط مرز 1 را انتخاب کنید. |
پایه ضعیف – آنی
اکنون شروع به اضافه کردن نمونه هایی (آنیلین و پیریدین) کنید که در طول الکتروفورز زون باید جدا شوند. یک راه سریع برای انجام این کار می‌تواند چندین بار تکرار یک گره موجود به جای ایجاد آن از ابتدا جدید باشد.
1 | در پنجره Model Builder ، روی Weak Base – tris کلیک راست کرده و Duplicate را انتخاب کنید . |
2 | در پنجره تنظیمات برای پایگاه ضعیف ، پایگاه ضعیف – ani را در قسمت متن برچسب تایپ کنید . |
3 | قسمت Weak Base را پیدا کنید . در قسمت متن نام گونه ، ani را تایپ کنید . |
4 | در قسمت متن p K a ، pKa_ani را تایپ کنید . |
5 | قسمت Diffusion and Migration را پیدا کنید . در قسمت متن u m ، mob_ani را تایپ کنید . |
تعاریف
از آنجایی که غلظت نمونه اولیه در کل دامنه یکنواخت نیست، باید مقادیر اولیه را با استفاده از توابع مشخص کنیم.
مستطیل 1 (راست1)
1 | در پنجره Model Builder گره Weak Base – ani را گسترش دهید . |
2 | روی Component 1 (comp1)>Definitions کلیک راست کرده و Functions>Rectangle را انتخاب کنید . |
تابع مستطیل یک تابع بین 0 و 1 ایجاد می کند.
3 | در پنجره تنظیمات برای Rectangle ، برای گسترش بخش Smoothing کلیک کنید . |
انتقال بین 0 و 1 به جای استفاده از یک مرحله گسسته به آرامی انجام می شود. این اعداد را هنگام حل مسئله بهبود می بخشد. تنظیمات هموارسازی را به حال خود رها کنید.
تابع نمونه
انواع مختلفی از عملکردها مانند پالس گاوسی، درون یابی، استپ و غیره موجود است. حالا یک تابع دوم به نام Analytic اضافه کنید تا تابع نمونه نهایی شود. تابع، مستطیل را بین 2.5٪ و 5٪ از طول فاصله هندسی قرار می دهد.
1 | در نوار ابزار Home ، روی  Functions کلیک کنید و Global>Analytic را انتخاب کنید . |
2 | در پنجره تنظیمات برای تحلیل ، تابع نمونه را در قسمت نوشتار برچسب تایپ کنید . |
3 | در قسمت متن نام تابع ، نمونه را تایپ کنید . |
4 | قسمت Definition را پیدا کنید . در قسمت متن Expression ، rect1((xL*0.0375)/(L*0.025)) را تایپ کنید . |
5 | قسمت Units را پیدا کنید . در جدول تنظیمات زیر را وارد کنید: |
بحث و جدل | واحد |
ایکس | متر |
6 | در قسمت Function text، 1 را تایپ کنید . |
7 | قسمت Plot Parameters را پیدا کنید . در جدول تنظیمات زیر را وارد کنید: |
بحث و جدل | حد پایین | حد بالا | واحد |
ایکس | 0 | L | متر |
8 |  روی Plot کلیک کنید . |
حمل و نقل الکتروفورتیک (EL)
غلظت اولیه 1
اکنون از تابع نمونه ای که ایجاد کرده اید برای تعریف توزیع غلظت اولیه گونه های آنیلین استفاده کنید.
1 | در پنجره Model Builder ، در قسمت Component 1 (comp1)>Electrophoretic Transport (el)>Weak Base – ani روی Initial Concentration 1 کلیک کنید . |
2 | در پنجره تنظیمات برای تمرکز اولیه ، قسمت تمرکز اولیه را پیدا کنید . |
3 | در قسمت متن c نمونه (x)*ani_c0 را تایپ کنید . |
تمرکز 1
1 | در پنجره Model Builder ، روی Concentration 1 کلیک کنید . |
2 | در پنجره تنظیمات برای تمرکز ، بخش تمرکز را پیدا کنید . |
3 | در قسمت متنی c 0 عدد 0 را تایپ کنید . |
پایه ضعیف – آنی
به همین ترتیب برای ایجاد گونه پیریدین اقدام کنید.
پایه ضعیف – پیر
1 | در پنجره Model Builder ، روی Weak Base – ani کلیک راست کرده و Duplicate را انتخاب کنید . |
2 | در پنجره تنظیمات برای پایگاه ضعیف ، پایگاه ضعیف – pyr را در قسمت متن برچسب تایپ کنید . |
3 | قسمت Weak Base را پیدا کنید . در قسمت متنی نام گونه ، pyr را تایپ کنید . |
4 | در قسمت متن p K a ، pKa_pyr را تایپ کنید . |
5 | قسمت Diffusion and Migration را پیدا کنید . در قسمت متن u m ، mob_pyr را تایپ کنید . |
غلظت اولیه 1
1 | در پنجره Model Builder ، گره Weak Base – pyr را گسترش دهید ، سپس روی Initial Concentration 1 کلیک کنید . |
2 | در پنجره تنظیمات برای تمرکز اولیه ، قسمت تمرکز اولیه را پیدا کنید . |
3 | در قسمت متن c نمونه (x)*pyr_c0 را تایپ کنید . |
پتانسیل 1
در نهایت، شرایط مرزی معادله پتانسیل الکترولیت را ارائه دهید.
1 | در نوار ابزار Physics ، روی  Boundaries کلیک کنید و Potential را انتخاب کنید . |
یک سطح بالقوه همیشه باید در جایی در مدل تعریف شود، در غیر این صورت هیچ راه حل منحصر به فردی برای مشکل وجود نخواهد داشت (که باعث خطای حل کننده می شود). در این حالت مرز سمت چپ را زمین می کنیم.
2 | فقط مرز 1 را انتخاب کنید. |
مقدار تنظیم پتانسیل پیش‌فرض ( 0[V] ) را همانطور که هست بگذارید.
چگالی جریان 1
1 | در نوار ابزار Physics ، روی  Boundaries کلیک کنید و Current Density را انتخاب کنید . |
2 | فقط مرز 2 را انتخاب کنید. |
3 | در پنجره تنظیمات برای چگالی جریان ، قسمت چگالی جریان الکترولیت را پیدا کنید . |
4 | در قسمت متن i n ,l ، -2500[A/m^2] را تایپ کنید . |
توجه داشته باشید که به جای استفاده از پارامترهای ( L و غیره) همانطور که قبلاً انجام دادیم، مقدار چگالی جریان را مستقیماً در اینجا مشخص می کنیم . براکت های [ و ] برای تعریف واحد استفاده می شوند. (آنها ممکن است در این مورد حذف شوند زیرا ما از واحدهای مشابهی به عنوان سیستم واحد مدل استفاده می کنیم).
تعاریف جهانی
ورودی های مدل پیش فرض
مقدار دمای مورد استفاده در کل مدل را تنظیم کنید.
1 | در پنجره Model Builder ، در قسمت Global Definitions، روی Default Model Inputs کلیک کنید . |
2 | در پنجره تنظیمات برای ورودی های مدل پیش فرض ، بخش Browse Model Inputs را پیدا کنید . |
3 | در درخت، General>Temperature (K) – minput.T را انتخاب کنید . |
4 | زیربخش عبارت برای انتخاب باقیمانده را پیدا کنید . در قسمت متن دما ، T را تایپ کنید . |
مش 1
مشکل را روی یک مش متشکل از 1000 عنصر حل کنید.
1 | در پنجره Model Builder ، در قسمت Component 1 (comp1) روی Mesh 1 کلیک کنید . |
2 | در پنجره تنظیمات مش ، بخش Sequence Type را پیدا کنید . |
3 | از لیست، مش کنترل شده توسط کاربر را انتخاب کنید . |
توزیع 1
1 | در پنجره Model Builder ، روی Edge 1 کلیک راست کرده و Distribution را انتخاب کنید . |
2 | در پنجره تنظیمات برای توزیع ، بخش توزیع را پیدا کنید . |
3 | در قسمت متنی Number of elements ، 1000 را تایپ کنید . |
هنگامی که مدل را حل کردید، می توانید به عقب برگردید و تعداد عناصر را افزایش دهید. این امر وضوح پیک های غلظت را در محلول افزایش می دهد، اما زمان محاسبه را نیز افزایش می دهد.
4 |  روی ساخت همه کلیک کنید . |
در حال حاضر، مش نهایی اکنون باید به صورت زیر باشد:
مطالعه 1
مشکل اکنون برای حل آماده است. توجه داشته باشید که زمان وابسته به مطالعه Initialization که در ابتدا در جادوگر مدل اضافه کردید، یک دنباله مطالعه متشکل از یک مرحله مطالعه Initialization توزیع فعلی و سپس یک مرحله وابسته به زمان ایجاد کرده است. مرحله اولیه سازی برای محاسبه پتانسیل اولیه و توزیع pH قبل از شروع حلگر وابسته به زمان استفاده می شود.
مرحله 2: وابسته به زمان
حل کننده را برای حل بین 0 تا 5 دقیقه تنظیم کنید، محلول را هر 30 ثانیه ذخیره کنید.
1 | در پنجره Model Builder ، در مطالعه 1 ، روی Step 2: Time Dependent کلیک کنید . |
2 | در پنجره تنظیمات مربوط به زمان وابسته ، قسمت تنظیمات مطالعه را پیدا کنید . |
3 | از لیست واحد زمان ، min را انتخاب کنید . |
4 |  روی Range کلیک کنید . |
5 | در کادر محاوره‌ای Range ، 0.5 را در قسمت متن Step تایپ کنید . |
6 | در قسمت متن توقف ، 5 را تایپ کنید . |
7 | روی Replace کلیک کنید . |
8 | در نوار ابزار صفحه اصلی ،  روی محاسبه کلیک کنید . |
اکنون مدل باید در حدود یک یا دو دقیقه حل شود.
نتایج
PH (
نمودارهای pH، رسانایی، پتانسیل و غلظت به طور پیش فرض ایجاد می شوند. برای مقایسه آنها با نمودارهای بخش نتایج و بحث، برای هر طرح به صورت زیر عمل کنید:
1 | در پنجره تنظیمات برای گروه طرح 1 بعدی ، برای گسترش بخش عنوان کلیک کنید . |
2 | از لیست نوع عنوان ، هیچکدام را انتخاب کنید . |
3 | قسمت Data را پیدا کنید . از لیست انتخاب زمان ، از لیست را انتخاب کنید . |
4 | در لیست Times (min) 0 و 4 را انتخاب کنید . |
نمودار خطی 1
1 | در پنجره Model Builder ، گره pH (el) را گسترش دهید ، سپس روی Line Graph 1 کلیک کنید . |
2 | در پنجره تنظیمات برای نمودار خط ، برای گسترش بخش Coloring and Style کلیک کنید . |
3 | از لیست Width ، 2 را انتخاب کنید . |
4 | در نوار ابزار pH (el) ، روی  Plot کلیک کنید . |
غلظت مولی – تریس (el)
در پنجره Model Builder ، گره Electrolyte Conductivity (el) را گسترش دهید .
غلظت مولی – HAC (el)
در پنجره Model Builder ، گره Molar Concentration – tris (el) را گسترش دهید .
غلظت نمونه
شما همچنین می توانید طرح های خود را ایجاد کنید. برای ایجاد نموداری که غلظت آنیلین و پیریدین را در همان نمودار مقایسه می کند، به صورت زیر عمل کنید.
1 | در پنجره Model Builder ، گره Molar Concentration – HAC (el) را گسترش دهید . |
2 | روی Molar Concentration – pyr (el) کلیک راست کرده و Duplicate را انتخاب کنید . |
3 | در پنجره تنظیمات برای گروه طرح 1 بعدی ، Sample Concentrations را در قسمت متن برچسب تایپ کنید . |
4 | قسمت Data را پیدا کنید . در لیست زمان (دقیقه) ، 1 را انتخاب کنید . |
5 | برای گسترش بخش عنوان کلیک کنید . از لیست نوع عنوان ، Label را انتخاب کنید . |
نمودار خطی 1
1 | در پنجره Model Builder ، گره Sample Concentrations را گسترش دهید ، سپس روی Line Graph 1 کلیک کنید . |
2 | در پنجره تنظیمات برای نمودار خط ، بخش y-Axis Data را پیدا کنید . |
3 | در قسمت Unit ، mM را تایپ کنید . |
4 | قسمت x-Axis Data را پیدا کنید . از لیست واحد ، cm را انتخاب کنید . |
5 | قسمت Coloring and Style را پیدا کنید . از لیست Width ، 2 را انتخاب کنید . |
6 | برای گسترش بخش Legends کلیک کنید . از فهرست Legends ، Manual را انتخاب کنید . |
7 | در جدول تنظیمات زیر را وارد کنید: |
افسانه ها |
پیریدین |
نمودار خط 2
1 | روی Results> Sample Concentrations> Line Graph 1 کلیک راست کرده و Duplicate را انتخاب کنید . |
2 | در پنجره تنظیمات برای نمودار خط ، روی Replace Expression در گوشه سمت راست بالای بخش y-Axis Data کلیک کنید . از منو، Component 1 (comp1)>Electrophoretic Transport>Weak Base – ani>el.c_ani – Concentration – mol/m³ را انتخاب کنید . |
3 | قسمت Coloring and Style را پیدا کنید . از لیست Width ، 2 را انتخاب کنید . |
4 | قسمت Legends را پیدا کنید . در جدول تنظیمات زیر را وارد کنید: |
افسانه ها |
آنیلین |
غلظت نمونه
اکنون می توانید غلظت ها را در 1 و 3 دقیقه به صورت زیر مقایسه کنید:
1 | در پنجره Model Builder ، روی Sample Concentrations کلیک کنید . |
2 | در نوار ابزار Sample Concentrations ، روی  Plot کلیک کنید . |
3 | در پنجره Settings for 1D Plot Group ، بخش Data را پیدا کنید . |
4 | در لیست Times (min) 3 را انتخاب کنید . |
5 | در نوار ابزار Sample Concentrations ، روی  Plot کلیک کنید . |
انیمیشن 1
شما همچنین می توانید یک انیمیشن از طرحی که ایجاد کرده اید، برای تمام زمان های ذخیره شده در راه حل ایجاد کنید.
1 | در نوار ابزار نتایج ، روی  انیمیشن کلیک کنید و Player را انتخاب کنید . |
2 | در پنجره تنظیمات انیمیشن ، بخش صحنه را پیدا کنید . |
3 | از لیست موضوع ، غلظت نمونه را انتخاب کنید . |
4 | قسمت Frames را پیدا کنید . از فهرست انتخاب فریم ، همه را انتخاب کنید . |
5 | قسمت Playing را پیدا کنید . در قسمت نمایش هر فریم برای متن، 0.5 را تایپ کنید . |
6 |  روی دکمه Play در نوار ابزار Graphics کلیک کنید . |
افزایش تعداد فریم ها در انیمیشن را می توان با کاهش مرحله افزایشی عملگر range() به عنوان مثال range(0,0.1,5) در Times در گره Time Dependent و حل مجدد بدست آورد.
