COMSOL Multiphysics همچنین می تواند از پنجره ترمینال با استفاده از پوسته اسکریپت COMSOL61/Multiphysics/bin/comsol راه اندازی شود .
برای اجرای آسانتر دستور comsol ، دایرکتوری COMSOL61/bin را در مسیر قرار دهید یا یک پیوند نمادین از /usr/bin/comsol به اسکریپت comsol ایجاد کنید. کسانی که دارای امتیازات مدیر هستند می توانند یک پیوند نمادین با دستور ایجاد کنند
(با فرض اینکه COMSOL در پوشه Applications نصب شده باشد). این دستور قبل از ایجاد لینک، رمز عبور می خواهد.
